Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06323 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06323 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06323 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06323 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06323 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06323 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06323 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06323 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06323 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06323 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06323 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06323 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06323 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06323 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06323 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06323 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06323 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P06323 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms