Protein–RNA interactions for Protein: P04940

Ig kappa chain V-VI region NQ2-17.4.1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04940 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P04940 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04940 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04940 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04940 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04940 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04940 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04940 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04940 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04940 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04940 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04940 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04940 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04940 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04940 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04940 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04940 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04940 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04940 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04940 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04940 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04940 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04940 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04940 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04940 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04940 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04940 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04940 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04940 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04940 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04940 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04940 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04940 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04940 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04940 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04940 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04940 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04940 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms