Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Ab1P01921 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms