Protein–RNA interactions for Protein: P01806

Ig heavy chain V region 441, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01806 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01806 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01806 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01806 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01806 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01806 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01806 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01806 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01806 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01806 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01806 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01806 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01806 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01806 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01806 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01806 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01806 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01806 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01806 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01806 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01806 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms