Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl20O89093 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl20O89093 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl20O89093 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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