Protein–RNA interactions for Protein: O89012

Magea8, MCG115467, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea8O89012 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Magea8O89012 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Magea8O89012 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Magea8O89012 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Magea8O89012 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Magea8O89012 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Magea8O89012 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Magea8O89012 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Magea8O89012 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Magea8O89012 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms