Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CcnkO88874 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CcnkO88874 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CcnkO88874 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CcnkO88874 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CcnkO88874 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms