Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp9O88851 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp9O88851 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms