Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cops6O88545 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops6O88545 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops6O88545 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops6O88545 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops6O88545 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops6O88545 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops6O88545 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms