Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nid2O88322 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nid2O88322 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nid2O88322 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nid2O88322 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nid2O88322 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms