Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaskO70589 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaskO70589 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaskO70589 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaskO70589 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaskO70589 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaskO70589 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CaskO70589 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CaskO70589 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CaskO70589 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CaskO70589 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CaskO70589 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CaskO70589 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CaskO70589 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CaskO70589 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CaskO70589 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CaskO70589 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CaskO70589 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CaskO70589 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CaskO70589 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CaskO70589 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CaskO70589 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CaskO70589 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CaskO70589 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CaskO70589 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CaskO70589 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CaskO70589 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CaskO70589 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CaskO70589 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CaskO70589 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CaskO70589 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CaskO70589 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CaskO70589 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CaskO70589 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CaskO70589 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms