Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtssO70370 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CtssO70370 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CtssO70370 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtssO70370 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtssO70370 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtssO70370 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtssO70370 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtssO70370 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtssO70370 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtssO70370 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtssO70370 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtssO70370 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtssO70370 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtssO70370 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtssO70370 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtssO70370 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtssO70370 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtssO70370 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtssO70370 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtssO70370 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtssO70370 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtssO70370 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtssO70370 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtssO70370 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtssO70370 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtssO70370 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CtssO70370 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CtssO70370 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtssO70370 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms