Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FiglaO55208 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FiglaO55208 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FiglaO55208 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FiglaO55208 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FiglaO55208 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FiglaO55208 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FiglaO55208 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FiglaO55208 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FiglaO55208 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FiglaO55208 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FiglaO55208 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms