Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pole2O54956 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pole2O54956 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pole2O54956 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pole2O54956 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms