Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EdaO54693 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EdaO54693 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EdaO54693 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EdaO54693 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EdaO54693 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EdaO54693 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EdaO54693 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EdaO54693 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EdaO54693 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EdaO54693 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EdaO54693 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EdaO54693 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EdaO54693 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EdaO54693 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EdaO54693 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EdaO54693 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EdaO54693 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EdaO54693 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EdaO54693 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EdaO54693 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EdaO54693 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EdaO54693 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EdaO54693 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EdaO54693 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EdaO54693 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EdaO54693 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EdaO54693 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EdaO54693 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EdaO54693 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EdaO54693 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EdaO54693 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EdaO54693 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EdaO54693 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EdaO54693 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EdaO54693 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EdaO54693 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EdaO54693 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EdaO54693 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EdaO54693 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EdaO54693 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EdaO54693 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EdaO54693 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EdaO54693 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EdaO54693 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EdaO54693 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EdaO54693 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EdaO54693 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EdaO54693 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EdaO54693 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EdaO54693 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EdaO54693 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EdaO54693 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EdaO54693 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EdaO54693 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EdaO54693 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EdaO54693 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EdaO54693 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EdaO54693 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EdaO54693 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EdaO54693 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EdaO54693 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EdaO54693 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EdaO54693 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EdaO54693 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EdaO54693 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EdaO54693 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EdaO54693 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms