Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab33bO35963 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rab33bO35963 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab33bO35963 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms