Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CaluO35887 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CaluO35887 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CaluO35887 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CaluO35887 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CaluO35887 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CaluO35887 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CaluO35887 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CaluO35887 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CaluO35887 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CaluO35887 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CaluO35887 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CaluO35887 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CaluO35887 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CaluO35887 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CaluO35887 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CaluO35887 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CaluO35887 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CaluO35887 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CaluO35887 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CaluO35887 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CaluO35887 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CaluO35887 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CaluO35887 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CaluO35887 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CaluO35887 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CaluO35887 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CaluO35887 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CaluO35887 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CaluO35887 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CaluO35887 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CaluO35887 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CaluO35887 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CaluO35887 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CaluO35887 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CaluO35887 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CaluO35887 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CaluO35887 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CaluO35887 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CaluO35887 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CaluO35887 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CaluO35887 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms