Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cnih1O35372 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cnih1O35372 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cnih1O35372 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cnih1O35372 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cnih1O35372 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnih1O35372 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms