Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KeraO35367 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KeraO35367 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KeraO35367 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KeraO35367 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KeraO35367 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KeraO35367 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KeraO35367 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KeraO35367 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KeraO35367 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KeraO35367 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KeraO35367 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KeraO35367 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KeraO35367 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KeraO35367 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KeraO35367 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KeraO35367 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KeraO35367 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KeraO35367 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KeraO35367 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KeraO35367 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KeraO35367 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KeraO35367 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KeraO35367 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KeraO35367 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KeraO35367 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KeraO35367 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KeraO35367 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KeraO35367 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KeraO35367 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KeraO35367 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KeraO35367 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KeraO35367 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KeraO35367 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KeraO35367 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KeraO35367 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms