Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pitx3O35160 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms