Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra3O35118 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra3O35118 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms