Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EllO08856 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EllO08856 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EllO08856 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EllO08856 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EllO08856 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EllO08856 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EllO08856 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EllO08856 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EllO08856 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EllO08856 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EllO08856 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EllO08856 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EllO08856 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EllO08856 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EllO08856 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EllO08856 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EllO08856 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EllO08856 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EllO08856 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EllO08856 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EllO08856 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EllO08856 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EllO08856 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EllO08856 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EllO08856 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EllO08856 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EllO08856 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EllO08856 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EllO08856 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EllO08856 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EllO08856 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EllO08856 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EllO08856 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EllO08856 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EllO08856 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EllO08856 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EllO08856 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EllO08856 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EllO08856 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EllO08856 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EllO08856 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EllO08856 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EllO08856 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EllO08856 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EllO08856 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms