Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gfra2O08842 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gfra2O08842 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms