Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sec22bO08547 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sec22bO08547 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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