Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsmbO08540 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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