Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm17078M0QW51 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm17078M0QW51 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm17078M0QW51 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm17078M0QW51 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm17078M0QW51 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm17078M0QW51 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm17078M0QW51 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm17078M0QW51 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm17078M0QW51 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm17078M0QW51 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm17078M0QW51 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17078M0QW51 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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