Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3278L7N2D2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms