Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IfnabL7MTU6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IfnabL7MTU6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IfnabL7MTU6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IfnabL7MTU6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IfnabL7MTU6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IfnabL7MTU6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IfnabL7MTU6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IfnabL7MTU6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms