Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccer2J3QPU5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccer2J3QPU5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccer2J3QPU5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms