Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a18J3QN01 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a18J3QN01 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms