Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm6176J3QK59 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm6176J3QK59 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6176J3QK59 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm6176J3QK59 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm6176J3QK59 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm6176J3QK59 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm6176J3QK59 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm6176J3QK59 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm6176J3QK59 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm6176J3QK59 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6176J3QK59 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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