Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20708H3BKF4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms