Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfgef1G3X9K3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfgef1G3X9K3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms