Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms