Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Speer4cG3UXD1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms