Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8220F6YKI2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms