Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptbn5F6UCX4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptbn5F6UCX4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms