Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm21977F6U3N7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm21977F6U3N7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm21977F6U3N7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm21977F6U3N7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm21977F6U3N7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm21977F6U3N7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm21977F6U3N7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm21977F6U3N7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm21977F6U3N7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm21977F6U3N7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21977F6U3N7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms