Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcmdc2E9Q956 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms