Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc71lE9Q4T4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc71lE9Q4T4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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