Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
5031410I06RikE9Q4E0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
5031410I06RikE9Q4E0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
5031410I06RikE9Q4E0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms