Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms