Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tarbp1E9Q368 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Tarbp1E9Q368 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tarbp1E9Q368 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms