Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Wdr17E9Q271 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr17E9Q271 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms