Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pdzd2E9Q1M1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd2E9Q1M1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd2E9Q1M1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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