Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1L0

Vmn2r80, Vomeronasal 2, receptor 80, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r80E9Q1L0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn2r80E9Q1L0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r80E9Q1L0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms