Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt78E9Q0F0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt78E9Q0F0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms