Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3095E9Q058 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms