Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gcom1E9PZ54 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcom1E9PZ54 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms