Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.7 ms